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私はそういった業界の者でもなんでもないんで間違った認識はあるかもしれませんが…

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Web標準に関してIEがイロイロ言われるのは、

CSSやJavaScriptの独自解釈や拡張、およびActiveXによる独自仕様が激しい（激しかった）からです。

FlashはあくまでObjectの1つに過ぎないので、Web標準とはあまり関係ないはずです。

むしろFlashプレーヤーがインストールされていれば基本的にどのPCでも同じように表現されるので

リッチなWebアプリケーションは（Ajaxが発展するまで）Flashで作られることが多かったと思います。

関係あるとすればおっしゃってるようにSEO（検索エンジン最適化）ですね。

検索サービスでのクロールは全くできないわけではなかったと思いますが、

決して効率のいいものでもありません。

Ajaxがもてはやされるのはそこも大きいでしょうね。

まずAdobeの公式Flash作成ツールの1つであるFlexはオープンソースだし、

Flexがオープンソースになる以前からOpenLaszloというFlexライクなオープンソースソフトが存在しています。

つまりFlashはオープンソースソフトウェアを利用することで作ることができるんです。

それとオープンソースソフトウェアはその名の通りソフトウェアをターゲットにしてるから、

Web関係はちょっと土俵が違うと思う。

オープンソースソフトウェアのターゲットはOSだったりOfficeだったりブラウザだったり画像処理ソフトだったり。

MSが対象にされやすいのは上の例を見たら一目瞭然ですよね。

ついでに言うと、Ajaxライブラリの登場以来、Flash自体の存在価値が減ってきてます。

今では動画での利用が大半を占めているし。

まぁ企業サイトとかでは未だFlashを利用しているところが多いけど。

うちもそうだけど、上役は動きのあるページを作りたがる傾向があるので、そういったのはやっぱりFlashの方が得意だから。

まぁでもAjax（というかJavaScript）なんてオープンソースそのものだから

それを使ってFlashの立場を奪おうとしていると考えると

言葉ではなく態度で反発していると言えなくもないのかもしれませんね。